- 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipeline for Germline Variant Calling from PacBio HiFi reads标题(中文):Sentieon DNAscope LongRead - 从 ... 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipeline for Germline Variant Calling from PacBio HiFi reads标题(中文):Sentieon DNAscope LongRead - 从 ...
- 1 Micromamba 简介大家是否有这样的经历,使用conda/anaconda进行环境配置的是否速度非常慢,进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚至有时候需要安装的软件比较多,或者需要用到conda-forge这个最大的channel,conda能一直卡在collecting步骤上直到http连接超时也没能处理完毕。直到有天小编发现了mamba这... 1 Micromamba 简介大家是否有这样的经历,使用conda/anaconda进行环境配置的是否速度非常慢,进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚至有时候需要安装的软件比较多,或者需要用到conda-forge这个最大的channel,conda能一直卡在collecting步骤上直到http连接超时也没能处理完毕。直到有天小编发现了mamba这...
- 亲爱的社区小伙伴们,我们很高兴地向大家宣布,在近期我们迎来了 Apache Doris 3.0 版本的正式发布,欢迎大家下载使用体验!从 3.0 系列版本开始,Apache Doris 开始支持存算分离模式,用户可以在集群部署时选择采用存算一体模式或存算分离模式。基于云原生存算分离的架构,用户可以通过多计算集群实现查询负载间的物理隔离以及读写负载隔离,并借助对象存储或 HDFS 等低成本的共... 亲爱的社区小伙伴们,我们很高兴地向大家宣布,在近期我们迎来了 Apache Doris 3.0 版本的正式发布,欢迎大家下载使用体验!从 3.0 系列版本开始,Apache Doris 开始支持存算分离模式,用户可以在集群部署时选择采用存算一体模式或存算分离模式。基于云原生存算分离的架构,用户可以通过多计算集群实现查询负载间的物理隔离以及读写负载隔离,并借助对象存储或 HDFS 等低成本的共...
- 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Chromosome-Level Genome Assembly of the Green Peafowl (Pavo muticus)标题(中文):绿孔雀(Pavo muticus)的染色体级基因组组装发表期刊:Genome Biology and Evolution作者单位:东北林业大学等发表年份:2022文章地址:https... 关键词:长读长测序;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Chromosome-Level Genome Assembly of the Green Peafowl (Pavo muticus)标题(中文):绿孔雀(Pavo muticus)的染色体级基因组组装发表期刊:Genome Biology and Evolution作者单位:东北林业大学等发表年份:2022文章地址:https...
- 导读: 为满足更严苛数据分析的需求,腾讯音乐内容库借助 Apache Doris 替代了 Elasticsearch 集群,统一了内容库数据平台的内容搜索和分析引擎。并基于 Doris 倒排索引和全文检索的能力,支持了复杂的自定义标签计算,实现秒级查询响应需求。此外,实现写入性能提升 4 倍、使用成本节省达 80% 的显著成效。相关文章:#腾讯音乐案例 、#Elasticsearch 到 A... 导读: 为满足更严苛数据分析的需求,腾讯音乐内容库借助 Apache Doris 替代了 Elasticsearch 集群,统一了内容库数据平台的内容搜索和分析引擎。并基于 Doris 倒排索引和全文检索的能力,支持了复杂的自定义标签计算,实现秒级查询响应需求。此外,实现写入性能提升 4 倍、使用成本节省达 80% 的显著成效。相关文章:#腾讯音乐案例 、#Elasticsearch 到 A...
- 亲爱的社区小伙伴们,Apache Doris 2.0.15 版本已于 2024 年 9 月 30 日正式与大家见面,该版本提交了 157 个改进项以及问题修复,进一步提升了系统的性能及稳定性,欢迎大家下载体验。立即下载:https://doris.apache.org/downloadGitHub 下载:https://github.com/apache/doris/releases/tag... 亲爱的社区小伙伴们,Apache Doris 2.0.15 版本已于 2024 年 9 月 30 日正式与大家见面,该版本提交了 157 个改进项以及问题修复,进一步提升了系统的性能及稳定性,欢迎大家下载体验。立即下载:https://doris.apache.org/downloadGitHub 下载:https://github.com/apache/doris/releases/tag...
- 关键词:流行病学;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Profiling SARS-CoV-2 mutation fingerprints that range from the viral pangenome to individual infection quasispecies标题(中文):剖析从病毒泛基因组到单个感染类群的 SARS-CoV-2 变异指纹图谱发表期刊:Genom... 关键词:流行病学;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Profiling SARS-CoV-2 mutation fingerprints that range from the viral pangenome to individual infection quasispecies标题(中文):剖析从病毒泛基因组到单个感染类群的 SARS-CoV-2 变异指纹图谱发表期刊:Genom...
- 亲爱的社区伙伴们,Apache Doris Flink Connector 24.0.0 版本已于 2024 年 9 月 5 日正式发布。该版本新增了对 Flink 1.20 的支持,并支持通过 Arrow Flight SQL 高速读取 Doris 中数据。此外,整库同步所依赖的 FlinkCDC,也需升级至 3.1.x 版本,以便更好的应用。下载地址:https://github.com... 亲爱的社区伙伴们,Apache Doris Flink Connector 24.0.0 版本已于 2024 年 9 月 5 日正式发布。该版本新增了对 Flink 1.20 的支持,并支持通过 Arrow Flight SQL 高速读取 Doris 中数据。此外,整库同步所依赖的 FlinkCDC,也需升级至 3.1.x 版本,以便更好的应用。下载地址:https://github.com...
- 研究展示了从无症状到危重症的大量 COVID-19 患者中血液样本的跨组学景观,提供了与COVID-19相关的新见解和治疗靶点,以及破译COVID-19及其潜在机制的宝贵线索。 研究展示了从无症状到危重症的大量 COVID-19 患者中血液样本的跨组学景观,提供了与COVID-19相关的新见解和治疗靶点,以及破译COVID-19及其潜在机制的宝贵线索。
- Apache Doris 内置支持包括 Hive、Iceberg、Hudi、Paimon、LakeSoul、JDBC 在内的多种 Catalog,并为其提供原生高性能且稳定的访问能力,以满足与数据湖的集成需求。而随着 Apache Doris 用户的增加,新的数据源连接需求也随之增加。因此,从 3.0 版本开始,Apache Doris 引入了 Trino Connector 兼容框架。Tr... Apache Doris 内置支持包括 Hive、Iceberg、Hudi、Paimon、LakeSoul、JDBC 在内的多种 Catalog,并为其提供原生高性能且稳定的访问能力,以满足与数据湖的集成需求。而随着 Apache Doris 用户的增加,新的数据源连接需求也随之增加。因此,从 3.0 版本开始,Apache Doris 引入了 Trino Connector 兼容框架。Tr...
- CNVscope是Sentieon推出的一款基于机器学习的全基因组CNV分析检测模块。该模块主要用于检测大于5kb的拷贝数增加或缺失,方法是通过分析reads的深度信息,并结合断点检测等其他特征进行拷贝数判断。 CNVscope是Sentieon推出的一款基于机器学习的全基因组CNV分析检测模块。该模块主要用于检测大于5kb的拷贝数增加或缺失,方法是通过分析reads的深度信息,并结合断点检测等其他特征进行拷贝数判断。
- 在竞争激烈的消费金融市场中,有效利用海量数据、提升业务运营效率是赢得市场的关键。早期招联采用典型的 Lambda 架构提供业务报表、数据运营、个性推荐、风险控制等数据服务,而 Lambda 过多的技术栈也引发了数据孤岛、查询效率不足、代码复用性差以及开发运维成本高昂等诸多问题。因此,招联引入 Apache Doris 对架构进行了升级,不仅替换了冗余的技术栈,还实现了实时数仓存储和计算引擎的... 在竞争激烈的消费金融市场中,有效利用海量数据、提升业务运营效率是赢得市场的关键。早期招联采用典型的 Lambda 架构提供业务报表、数据运营、个性推荐、风险控制等数据服务,而 Lambda 过多的技术栈也引发了数据孤岛、查询效率不足、代码复用性差以及开发运维成本高昂等诸多问题。因此,招联引入 Apache Doris 对架构进行了升级,不仅替换了冗余的技术栈,还实现了实时数仓存储和计算引擎的...
- 湖仓一体(Data Lakehouse)融合了数据仓库的高性能、实时性以及数据湖的低成本、灵活性等优势,能够更加便捷地满足各种数据处理分析的需求。Apache Doris 持续加深与数据湖的融合,已演进出一套成熟的湖仓一体解决方案。我们将通过一系列文章介绍 Apache Doris 与各类主流数据湖格式及存储系统的湖仓一体架构搭建指南,包括 Hudi、Paimon、Iceberg、OSS、D... 湖仓一体(Data Lakehouse)融合了数据仓库的高性能、实时性以及数据湖的低成本、灵活性等优势,能够更加便捷地满足各种数据处理分析的需求。Apache Doris 持续加深与数据湖的融合,已演进出一套成熟的湖仓一体解决方案。我们将通过一系列文章介绍 Apache Doris 与各类主流数据湖格式及存储系统的湖仓一体架构搭建指南,包括 Hudi、Paimon、Iceberg、OSS、D...
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